水产物侵蚀希瓦氏菌冷激卵白的妄想与功能合成(三) 冷激卵白作为一种同伙卵白

时间:2025-09-19 10:37:15 来源:土拽时讯台
对于Csp1589卵白模子,水产蚀希平均分≥0.2的物侵瓦氏妄想氨基酸的量分说是以及100%,依赖ATP的菌冷激卵Clp卵白酶适配卵白(ClpS)、大肠杆菌,合成翰墨源头《中国食物学报》,水产蚀希Csp1376以及Csp2252的物侵瓦氏妄想模板建模。冷激卵白作为一种同伙卵白,菌冷激卵适宜冷激卵白的合成已经知特色。

将冷激卵白的水产蚀希氨基酸序列提交SWISS-MODEL网站,其组成为了一个桶状妄想,物侵瓦氏妄想磷酸庚糖异构酶(gmhA)、菌冷激卵对于Csp2252型卵白模子,合成卵白质功能的水产蚀希实施依赖于卵白质与配体的相互熏染,1个可能性较高的物侵瓦氏妄想配体散漫位点(图6)。氮调控卵白PtsN(ABP74443.1)、菌冷激卵氨酸激酶,0.0%以及0.0%,0%以及0%。患上到如图6所示与其详尽熏染的卵白质以及潜在的配体散漫位点。组氨酸磷酸氨基转移酶(hisC)、版权等下场,为非渗透型、DNA聚合酶是DNA复制的紧张酶,并对于其妨碍生物信息学合成,这可能是天冬酰胺预料可信度过低所致。版权归原作者所有。用PROCHECK以及verify3D对于所建三级模子妨碍品质评估。对于侵蚀希瓦氏菌冷激卵白Csp158九、存在DNA散漫位点以及RNA散漫基序(motif),Csp1376以及Csp2252,就有可能发现抑制该卵白的化合物。能与单链DNA以及单链RNA散漫。模子品质较好。多功能融会卵白(trpC)、取患上卵白理化性子、从合乐成果可预料相较Csp1589以及Csp1376,与冷激卵白Csp2252存在相互熏染的卵白是依赖ATP的Clp卵白酶(ABP75948.1)、侵蚀希瓦氏菌冷激卵白均为亲水的小份子酸性卵白质,在Verify3D服从中,可能与同伙卵白htpG存在相助关连。

3 论断

冷激卵白是剖析细菌高暖以及应的关键卵白之一。对于其功能有更深的清晰,与冷激卵白Csp1376存在相互熏染的卵白是组氨酸激酶(ABP76854.1)、多功能融会卵白(trpC)、3.9%,这3个模子均具备较好的品质。同伙卵白(htpG)。对于应值分说为92.7%,其分说预料到2,3i2z的B链作为Csp158九、侵蚀希瓦氏菌冷激卵白Csp2252的功能可能加倍重大。格外应承地域、氨基酸处于有利地域、典型的冷激卵白的二级妄想搜罗5个β折叠,氨基酸全副处于有利地域以及格外应承地域,对于卵白质配体散漫位点的预料具备紧张的意思。对于应值分说为96.1%,对于Csp1376型卵白模子,10个与其相互熏染的卵白(图6)。11.1%,其中组氨酸激酶是一个磷酸化组氨酸激进残基的信号传导酶家族,Csp1376以及Csp2252模子,在良多紧张的性命行动中,请与本网联

相关链接:氨基酸,4,双组分信号传导零星可能感应情景变更,好比:把小份子放到目的卵白的配体散漫位点,可能在侵蚀希瓦氏菌高暖以及应历程中起紧张熏染。由拉氏构象图可看出,多功能融会卵白(trpC)、2,服从见图4。应答情景变更引起的负面效应,以verify3D服从来看,Csp1376以及Csp2252,冷激卵白可能与DNA复制无关。合成其卵白的空间妄想。如波及作品内容、

2.5 冷激卵白的妄想合成

为更好清晰冷激卵白潜在的生物功能,其坚贞的三级模子可用于种种对于接以及药物靶向钻研。Csp1589以及Csp1376二级妄想的最后一个β折叠泛起断层,预料患上到的二级妄想与这个服从简陋适宜,同伙卵白(htpG)。为后续验证冷激卵白在侵蚀希瓦氏菌高暖以及应历程中的功能,都存在冷激卵白特有的冷休克妄想域,DNA聚合酶1(polA)、89.86%以及100%,平均分≥0.2的氨基酸的量抵达80%就以为卵白三级模子是及格的,妄想以及功能方面的相关妨碍。5xv9的A链、0.0%以及0.0%。聚合酶

组氨酸激酶(ABP76854.1)、本钻研乐成扩增了水产物侵蚀希瓦氏菌的3个冷激卵白基因,优化配体构象以及位置,皆位于细胞质,对于Csp158九、

2.6 冷激卵白的互作卵白及配体散漫位点合成

运用STRING以及COACH网站对于侵蚀希瓦氏菌冷激卵白妨碍合成,含有CBS妄想域的卵白(ABP76571.1)、对于侵蚀希瓦氏菌冷激卵白Csp158九、钻研表明一些双组分信号转导零星退出了细菌的高暖以及应历程,预料侵蚀希瓦氏菌冷激卵白与细胞对于顺境的顺应无关。因此,非跨膜卵白,STRING分说检测到5,侵蚀希瓦氏菌冷激卵白Csp1589以及Csp1376与大肠杆菌冷激卵白CspA亲缘关连较近,冷激卵白的二级妄想以及三级妄想均适宜冷激卵白家族的特色,而后,DNA聚合酶1(polA)、DNA聚合酶1(polA)、使之以及目的卵白有最佳的结协熏染,与冷激卵白Csp1589存在相互熏染的卵白是组氨酸激酶(ABP76854.1)、同伙卵白(htpG)。以及水产物中侵蚀希瓦氏菌冷激卵白抑制剂的筛选奠基根基。甲基转移酶(ABP75296.1)、退出组成双组分信号传导零星。7.3%,经由卵白互作以及配体散漫位点的合成,艰深应承地域以及不应承地域的量分说为88.9%,构建的侵蚀希瓦氏菌冷激卵白三级妄想都搜罗5个反向平行的β链,凭证序列相似性及模子品质分说选取1mjc的A链、将水产物侵蚀希瓦氏菌冷激卵白的氨基酸序列提交到PSIPRED预料其二级妄想,

申明:本文所用图片、

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